Para Atualizar certificado A1 acesse Notas >> Lyncis NF-e >> NF-e Configurações:

Selecione a empresa no combo, abaixo, clicando na setinha apontada para baixo.

Ao selecionar a empresa, agora clique em certificado. Depois no grid clique em cima da numeração do certificado.

Ao clicar no grid será liberado o botão com  3 pontinhos … , clique e então selecione o certificado ja instalado. Caso não esteja, utilize esse guia para instalação, clique aqui.

Agora, informe a senha, informe o caminho do arquivo do certificado com extensão .pfx

(IMPORTANTE: O arquivo PFX deve ficar e ser apontado na pasta da Lyncis Sistemas, em L:\

E altere a data de validade

Agora, caso o APP Lyncis NFe esteja aberto, feche-o e reabra, e assim a troca terá sido concluída.

Segue um breve vídeo mostrando na pratica a atualização do certificado.